Только командой: компонент max_stack_size задаёт стопку предмета от 1 до 99. Больше 99 игра не примет — команда /give @s minecraft:ender_pearl[max_stack_size=100] отвечает ошибкой ещё до выполнения. Готовые команды — в «Коротко» наверху.

Предмет с прочностью стакаться не может: если у него есть max_damage, а стопка больше 1, игра откажется выдавать такой предмет. Поэтому стопку мечей или кирок не сделать даже командой.

Обычная стопка у всего, что не перечислено выше, — 64. Остальные компоненты предметов — на странице компонентов для /give.