Папку создаёт официальный лаунчер при первом запуске. Сторонние лаунчеры часто держат игру в своей папке — у каждой сборки своя, и открывается она кнопкой в настройках лаунчера, а не по пути выше. JuxLauncher тоже хранит игру в своей папке, а не в .minecraft.